对外援助司是中华人民共和国商务部直属事业单位，其主要职责是拟订并组织实施对外援助的政策和方案，推进对外援助方式改革；组织对外援助谈判并签署协议，处理政府间援助事务；编制对外援助计划并组织实施；监督检查对外援助项目的实施。
对外援助司下设办公室、综合处、计划信息处、法规处、质量监管处（总工程师办公室）、国际交流与合作处、人力资源开发处、亚洲一处、亚洲二处、非洲一处、非洲二处、非洲三处、西亚北非欧洲处、拉美处、南太处14处1室。