齐齐哈尔市食品药品监督管理局于2001年12月28日正式成立，其主要职责是对辖区内的药品、医疗器械的研制、生产、经营、使用单位进行全过程的监督管理。下设一个区食品药品监督管理分局及市食品药品监督管理稽查支队和市药品检验所。局机关内设二办六科（办公室、党办、食品安全科、药品市场监督科、药品安全监管科、医疗器械科、人事教育科、财务审计科）。