吉林大学图书馆前身为东北行政学院图书馆，1946年创办于哈尔滨。1952年改称东北人民大学图书馆。1958年改称吉林大学图书馆。2000年原吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学和长春邮电学院合并组成新吉林大学，原五校图书馆也随之合并。合校后的吉林大学图书馆设有中心馆、工学馆、医学馆、地学馆和信息学馆。 2004年中国人民解放军军需大学并入吉林大学，其图书馆改为吉林大学农学部图书馆。